Vazyme Fast Hi-C Assay Kit
诺唯赞 快速Hi-C试剂盒
10 h快速Hi-C建库，1库顶4库，1万细胞也能看Loop。
产品应用
染色质互作、三维基因组
产品简介
Fast Hi-C Assay Kit是用于简单快速获取全基因组DNA - DNA空间互作信息的试剂盒。Hi-C (High-throughput Chromosome Conformation Capture)是一种用于研究染色质三维空间构象的高通量测序技术，通过交联、酶切、标记、连接等一系列步骤，使空间上彼此靠近的染色体区域相连，形成有效互作的DNA片段，并进行高通量测序。通过对测序数据进行生信分析，推断染色体在三维空间中的结构。相比于3C技术，Hi-C技术能够同时测定染色体上成千上万个位置之间的相互作用，从而更全面地揭示染色体的三维结构。本试剂盒优化了实验反应体系和操作流程，具有检测成功率高、实验周期短、操作简单等优势，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。试剂盒中所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证，最大程度上保证了实验结果的稳定性和重复性。
产品优势
1. 实验速度快：10 h完成Hi-C文库构建；
2. 细胞投入量少：兼容1 w - 50 w细胞投入量；
3. 数据质量好：可实现Valid Pairs ≥90%，长程互作占比＞50%；
4. 文库复杂度高：单个文库兼容600 - 900 G测序量。
性能展示
1. 有效数据占比高
投入500,000个Hela细胞使用Fast Hi-C Assay Kit (Vazyme #TD801)进行Hi-C文库构建，MGI平台测序800 G后使用诺唯赞生物信息云平台(https://vazyme-biocloud.vazyme.com:5174/)进行数据分析。结果显示Valid Pairs占比大于90% (图1)。
图1. Hi-C文库Valid Pairs占比
2. ＞20 kb长程互作占比高
投入500,000个Hela细胞使用Fast Hi-C Assay Kit (Vazyme #TD801)进行Hi-C文库构建，MGI平台测序800 G后使用诺唯赞生物信息云平台(https://vazyme-biocloud.vazyme.com:5174/)进行数据分析。结果显示长程互作占比大于50% (图2)。
图2. Hi-C文库长程互作(Cis long-range (>20 kb))占比
3. 兼容低细胞投入量
投入10,000个Hela细胞使用Fast Hi-C Assay Kit (Vazyme #TD801)进行Hi-C文库构建，MGI平台测序800 G后使用诺唯赞生物信息云平台(https://vazyme-biocloud.vazyme.com:5174/)进行数据分析。结果显示Valid Pairs ＞90%， ＞20 kb的长程互作占比大于50%，在5 kb分辨率下染色质环清晰(图3)。
图3. 10,000个Hela细胞构建Hi-C文库下机数据
A. Hi-C文库有效数据占比
B. Hi-C文库长程互作(Cis long-range (>20 kb))占比
C. Hi-C文库5 kb分辨率下Loop热图
组分&说明
保存条件
BOX 1：2 ~ 8℃保存，冰袋运输。
BOX 2：-30 ~ -15℃保存，≤0℃运输。
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