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3月客户文章精选|肠道铁死亡、放射免疫协同与线粒体编辑的创新突破
文章标题:Extensive mutual influences of SMC complexes shape 3D genome folding
客户单位:深圳湾实验室
通讯作者:张浩岳、黄恺
发表日期:2025.02.26
文章研究成果:该研究揭示了SMC复合体(extrusive cohesin、cohesive cohesin和condensin)在三维基因组动态折叠中的互作机制。研究发现,condensin通过破坏extrusive cohesin在CTCF位点的结合,促进分裂间期拓扑相关结构域(TADs)和染色质环解体;extrusive cohesin则抑制condensin介导的染色体螺旋化。研究还表明,cohesive cohesin无法被CTCF直接捕获,也无法独立性差TADs或染色质环,而是通过限制extrusive cohesin的移动性,抑制染色质环的扩展。condensin通过清除或重定位两种cohesin的染色质结合位点,调控基因组结构的动态重塑。SMC复合体通过动态的相互抑制与协同,精细调控染色质从间期到分裂期的三维结构重塑,为理解基因组折叠的分子机制提供了重要视角。
查看原文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40011778/
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VAHTS Universal DNA Library Prep Kit for MGI 机械法DNA建库试剂盒 |
24 rxns/96 rxns |
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VAHTS DNA Clean Beads 纯化分选磁珠 |
5 ml/60 ml/450 ml |
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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2 片段化酶法DNA建库试剂盒 |
24 rxns/96 rxns |
Immunity (IF: 25.5)
文章标题:Bile acid receptor FXR promotes intestinal epithelial ferroptosis and subsequent ILC3 dysfunction in neonatal necrotizing enterocolitis
客户单位:天津医科大学
通讯作者:周洁
发表日期:2025.2.28
文章研究成果:该研究揭示了胆汁酸受体FXR在新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)中的作用及机制。研究发现,NEC患者和小鼠模型的肠道上皮细胞(IECs)中FXR表达显著增加,FXR表达与新生儿的胎龄或出生体重呈负相关,与炎症标志物呈正相关。FXR通过转录调控ACSL4的表达,促进IECs中的铁死亡,导致脂质过氧化物的释放,这些氧化脂质会抑制免疫细胞ILC3s分泌IL-22,从而加剧肠道炎症。研究还发现,短链脂肪酸产生菌的减少会增加FXR的表达,而补充短链脂肪酸可抑制FXR的表达,粪便移植实验也证实了这一结论。综上,该研究为NEC的治疗提供了新的靶点,并强调了肠道菌群、IECs和ILC3s之间的复杂相互作用在新生儿肠道健康中的重要性。
查看原文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40023163/
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Duo-Lite Luciferase Assay System 辉光型双荧光素酶报告基因检测试剂盒 |
10 ml/100 ml |
Cancer Cell (IF: 48.8)
文章标题:PAI-1-driven SFRP2high cancer-associated fibroblasts hijack the abscopal effect of radioimmunotherapy
客户单位:南方医科大学南方医院
通讯作者:董忠谊、吴德华、白雪、官键
发表日期:2025.3.12
文章研究成果:本文揭示了PAI-1驱动的SFRP2high癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过劫持微环境抑制放射免疫治疗远隔效应的分子机制。研究通过体内CRISPR筛选发现SFRP2是潜在的基质调节因子,其在CAFs中高表达,且在放射免疫治疗后未辐射的肿瘤中显著上调。SFRP2high CAFs通过重塑血管免疫抑制微环境,阻碍CD8+T细胞浸润,从而阻碍远隔效应。研究还发现,经辐射的肿瘤分泌的PAI-1通过血液传播至远隔肿瘤,诱导周细胞向SFRP2high CAFs转化,通过阻断SFRP2或PAI-1,可增强放射免疫治疗的远隔效应。综上,该研究阐明了放射免疫治疗中远隔效应受限的机制,为提高放免疫治疗效果提供了新的靶点和临床应用前景。
查看原文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40086438/
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HiScript IV All-in-One Ultra RT SuperMix for qPCR 逆转录预混液 |
100 rxns |
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Taq Pro Universal SYBR qPCR Master Mix 染料法荧光定量专用预混液 |
500 rxns/2500 rxns |
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2 × Rapid Taq Master Mix 快速PCR |
5×1 ml/15×1 ml/50×1 ml/10×5 ml |
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100 bp DNA Ladder DNA marker |
50 rxns/100 rxns |
Nature Biotechnology (IF: 33.1)
文章标题:Leveraging base excision repair for efficient adenine base editing of mitochondrial DNA
客户单位:上海科技大学生命学院
通讯作者:陈佳
发表日期:2025.3.25
文章研究成果:该文揭示了TALED介导线粒体DNA(mtDNA)腺嘌呤碱基编辑的分子机制,并提出高效编辑新策略。研究发现,TALED通过双链DNA特异的胞嘧啶脱氨酶DddA诱导的C到U脱氨触发碱基切除修复过程,形成单链DNA区域,为TadA8e介导的A到I脱氨提供底物,从而实现A到G编辑。基于此机制,研究团队通过替换DddA为高活性变体DddA6,并融合人源UDG,开发了增强型编辑器eTALEDs,使编辑效率提升2-4倍。实验证实,增强型TALEDs可在mtDNA中高效引入Leigh综合征和MELAS相关致病突变,且旁观者编辑减少至10.89%。优化的编辑器在多种细胞中均展现高效性,且全基因组测序显示未引起核基因组脱靶突变。该研究为线粒体遗传病的精准治疗提供了新型工具,同时为基于碱基切除修复通路的编辑器设计开辟了新方向。
查看原文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40133517/
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ClonExpress Ultra One Step Cloning Kit V3 快速克隆试剂盒 |
20 rxns/40 rxns |
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Phanta Max Super-Fidelity DNA Polymerase 高保真PCR |
100 U/500 U/1000 U |
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FastPure Cell/Tissue DNA Isolation Mini Kit DNA提取试剂盒 |
100 rxns |
Nature Biotechnology (IF: 33.1)
文章标题:Specific and efficient RNA A-to-I editing through cleavage of an ADAR inhibitor
客户单位:上海科技大学
通讯作者:陈佳、杨力
发表日期:2025.3.26
文章研究成果:这篇文章介绍了一种新型的RNA编辑工具——RtABE,用于实现高效且特异性的RNA A-to-I编辑。研究人员通过筛选发现,某些蛋白域能够抑制ADAR2脱氨酶(ADAR2DD)的活性,这些蛋白域被称为ADAR抑制剂(ADIs)。基于ADIs,研究团队开发了RtABE系统,该系统在未结合目标RNA时保持惰性,只有在结合目标RNA后ADIs才会被切割,从而激活ADAR2DD进行编辑。RtABE系统在多种序列背景下(如UAN、AAN、CAN和GAN)均能实现高效的RNA编辑,并且在转录组范围内的非靶向编辑水平接近背景水平,显示出极高的编辑特异性。此外,研究人员通过腺相关病毒(AAV)将RtABE递送至Hurler综合征小鼠模型中,成功校正了致病突变,恢复了α-L-艾杜糖苷酶的活性,且未检测到显著的非靶向编辑。RtABE的开发为RNA编辑技术的发展提供了新的方向,有望在未来的基因治疗中发挥重要作用。
查看原文:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40140558/
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